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CHANGED
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@@ -1,21 +1,10 @@
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| 1 |
import gradio as gr
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| 2 |
import torch
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| 3 |
-
from transformers import AutoModelForCausalLM, AutoTokenizer
|
| 4 |
import time
|
| 5 |
from functools import wraps
|
| 6 |
import sys
|
| 7 |
-
|
| 8 |
-
# Intentar importar 'spaces' para usar el decorador GPU si está disponible
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| 9 |
-
try:
|
| 10 |
-
import spaces
|
| 11 |
-
except ImportError:
|
| 12 |
-
# Si 'spaces' no está disponible, definir un decorador vacío
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| 13 |
-
def GPU(duration):
|
| 14 |
-
def decorator(func):
|
| 15 |
-
return func
|
| 16 |
-
return decorator
|
| 17 |
-
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| 18 |
-
spaces = type('spaces', (), {'GPU': GPU})
|
| 19 |
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| 20 |
# Decorador para medir el tiempo de ejecución
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| 21 |
def medir_tiempo(func):
|
|
@@ -29,110 +18,125 @@ def medir_tiempo(func):
|
|
| 29 |
return resultado
|
| 30 |
return wrapper
|
| 31 |
|
| 32 |
-
#
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| 33 |
device = "cuda" if torch.cuda.is_available() else "cpu"
|
| 34 |
if device == "cpu":
|
| 35 |
print("Advertencia: CUDA no está disponible. Se usará la CPU, lo que puede ser lento.")
|
| 36 |
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| 37 |
-
#
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| 38 |
-
|
| 39 |
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| 40 |
-
# Cargar el tokenizador desde el directorio local
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| 41 |
try:
|
| 42 |
-
print(
|
| 43 |
-
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained(
|
| 44 |
except ValueError as e:
|
| 45 |
print(f"Error al cargar el tokenizador: {e}")
|
| 46 |
sys.exit(1)
|
| 47 |
-
except Exception as e:
|
| 48 |
-
print(f"Error inesperado al cargar el tokenizador: {e}")
|
| 49 |
-
sys.exit(1)
|
| 50 |
-
|
| 51 |
-
# Ruta al modelo local
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| 52 |
-
model_path = "yangheng/OmniGenome"
|
| 53 |
|
| 54 |
-
# Cargar el modelo desde el archivo local
|
| 55 |
try:
|
| 56 |
-
print(f"Cargando el modelo GenerRNA desde '{model_path}'...")
|
| 57 |
model = AutoModelForCausalLM.from_pretrained(
|
| 58 |
-
|
| 59 |
torch_dtype=torch.float16 if device == "cuda" else torch.float32
|
| 60 |
).to(device)
|
| 61 |
-
|
| 62 |
-
print("
|
| 63 |
-
except FileNotFoundError:
|
| 64 |
-
print(f"Error: El archivo del modelo '{model_path}' no se encontró.")
|
| 65 |
sys.exit(1)
|
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| 66 |
except Exception as e:
|
| 67 |
-
print(f"Error al cargar el modelo
|
| 68 |
sys.exit(1)
|
| 69 |
|
| 70 |
@spaces.GPU(duration=120) # Decorador para asignar GPU durante 120 segundos
|
| 71 |
@medir_tiempo
|
| 72 |
-
def
|
| 73 |
"""
|
| 74 |
-
Función que genera una
|
| 75 |
"""
|
| 76 |
try:
|
| 77 |
-
if not
|
| 78 |
-
return "Por favor, ingresa una
|
| 79 |
-
|
| 80 |
-
# Tokenizar la
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| 81 |
-
inputs = tokenizer.encode(
|
| 82 |
-
|
| 83 |
-
#
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| 84 |
with torch.no_grad():
|
| 85 |
-
outputs = model.generate(
|
| 86 |
-
|
| 87 |
-
|
| 88 |
-
|
| 89 |
-
|
| 90 |
-
|
| 91 |
-
|
| 92 |
-
|
| 93 |
-
do_sample=True
|
| 94 |
-
)
|
| 95 |
-
|
| 96 |
-
# Decodificar la secuencia generada
|
| 97 |
-
generated_sequence = tokenizer.decode(outputs[0], skip_special_tokens=True)
|
| 98 |
-
return generated_sequence
|
| 99 |
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| 100 |
except Exception as e:
|
| 101 |
-
print(f"Error durante la
|
| 102 |
-
return f"Error al
|
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| 103 |
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| 104 |
# Definir la interfaz de Gradio
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| 105 |
-
titulo = "
|
| 106 |
-
descripcion =
|
| 107 |
-
"GenerRNA es un modelo generativo de RNA basado en una arquitectura Transformer. "
|
| 108 |
-
"Ingresa una secuencia inicial opcional y define la longitud máxima para generar nuevas secuencias de RNA."
|
| 109 |
-
)
|
| 110 |
|
| 111 |
iface = gr.Interface(
|
| 112 |
-
fn=
|
| 113 |
inputs=[
|
| 114 |
-
gr.Textbox(
|
| 115 |
-
|
| 116 |
-
|
| 117 |
-
|
| 118 |
-
),
|
| 119 |
-
gr.
|
| 120 |
-
minimum=50,
|
| 121 |
-
maximum=1000,
|
| 122 |
-
step=50,
|
| 123 |
-
value=256,
|
| 124 |
-
label="Longitud Máxima de la Secuencia"
|
| 125 |
-
)
|
| 126 |
],
|
| 127 |
-
outputs=gr.Textbox(label="Secuencia de RNA Generada"),
|
| 128 |
title=titulo,
|
| 129 |
description=descripcion,
|
| 130 |
examples=[
|
| 131 |
[
|
| 132 |
-
"
|
| 133 |
],
|
| 134 |
[
|
| 135 |
-
"
|
| 136 |
]
|
| 137 |
],
|
| 138 |
cache_examples=False,
|
|
|
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| 1 |
import gradio as gr
|
| 2 |
import torch
|
| 3 |
+
from transformers import AutoModelForCausalLM, AutoTokenizer, MarianMTModel, MarianTokenizer
|
| 4 |
import time
|
| 5 |
from functools import wraps
|
| 6 |
import sys
|
| 7 |
+
import spaces # Asegúrate de que este módulo esté disponible y correctamente instalado
|
|
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| 8 |
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| 9 |
# Decorador para medir el tiempo de ejecución
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| 10 |
def medir_tiempo(func):
|
|
|
|
| 18 |
return resultado
|
| 19 |
return wrapper
|
| 20 |
|
| 21 |
+
# Verificar si CUDA está disponible para el modelo principal
|
| 22 |
device = "cuda" if torch.cuda.is_available() else "cpu"
|
| 23 |
if device == "cpu":
|
| 24 |
print("Advertencia: CUDA no está disponible. Se usará la CPU, lo que puede ser lento.")
|
| 25 |
|
| 26 |
+
# Cargar el tokenizador y el modelo principal desde HuggingFace
|
| 27 |
+
model_name = "dmis-lab/selfbiorag_7b"
|
| 28 |
|
|
|
|
| 29 |
try:
|
| 30 |
+
print("Cargando el tokenizador y el modelo desde HuggingFace...")
|
| 31 |
+
tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained(model_name)
|
| 32 |
except ValueError as e:
|
| 33 |
print(f"Error al cargar el tokenizador: {e}")
|
| 34 |
sys.exit(1)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 35 |
|
|
|
|
| 36 |
try:
|
|
|
|
| 37 |
model = AutoModelForCausalLM.from_pretrained(
|
| 38 |
+
model_name,
|
| 39 |
torch_dtype=torch.float16 if device == "cuda" else torch.float32
|
| 40 |
).to(device)
|
| 41 |
+
except Exception as e:
|
| 42 |
+
print(f"Error al cargar el modelo: {e}")
|
|
|
|
|
|
|
| 43 |
sys.exit(1)
|
| 44 |
+
|
| 45 |
+
# Cargar el modelo de traducción en CPU
|
| 46 |
+
try:
|
| 47 |
+
print("Cargando el tokenizador y el modelo de traducción en CPU...")
|
| 48 |
+
translation_model_name = "Helsinki-NLP/opus-mt-en-es"
|
| 49 |
+
translator_tokenizer = MarianTokenizer.from_pretrained(translation_model_name)
|
| 50 |
+
translator_model = MarianMTModel.from_pretrained(translation_model_name).to("cpu") # Forzar a CPU
|
| 51 |
except Exception as e:
|
| 52 |
+
print(f"Error al cargar el modelo de traducción: {e}")
|
| 53 |
sys.exit(1)
|
| 54 |
|
| 55 |
@spaces.GPU(duration=120) # Decorador para asignar GPU durante 120 segundos
|
| 56 |
@medir_tiempo
|
| 57 |
+
def generar_respuesta(consulta):
|
| 58 |
"""
|
| 59 |
+
Función que genera una respuesta a partir de una consulta dada.
|
| 60 |
"""
|
| 61 |
try:
|
| 62 |
+
if not consulta.strip():
|
| 63 |
+
return "Por favor, ingresa una consulta válida."
|
| 64 |
+
|
| 65 |
+
# Tokenizar la consulta
|
| 66 |
+
inputs = tokenizer.encode(consulta, return_tensors="pt").to(device)
|
| 67 |
+
|
| 68 |
+
# Configurar los parámetros de generación
|
| 69 |
+
generation_kwargs = {
|
| 70 |
+
"max_new_tokens": 100, # Ajustado a 100
|
| 71 |
+
"do_sample": False # No usar sampling
|
| 72 |
+
# "temperature": 0.6, # Eliminado para evitar advertencias
|
| 73 |
+
# "top_p": 0.9 # Eliminado para evitar advertencias
|
| 74 |
+
}
|
| 75 |
+
|
| 76 |
+
# Generar la respuesta
|
| 77 |
with torch.no_grad():
|
| 78 |
+
outputs = model.generate(input_ids=inputs, **generation_kwargs)
|
| 79 |
+
|
| 80 |
+
# Decodificar la respuesta
|
| 81 |
+
respuesta = tokenizer.decode(outputs[0], skip_special_tokens=True)
|
| 82 |
+
return respuesta
|
| 83 |
+
except Exception as e:
|
| 84 |
+
print(f"Error durante la generación de respuesta: {e}")
|
| 85 |
+
return f"Error al generar la respuesta: {e}"
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 86 |
|
| 87 |
+
def traducir_texto(texto):
|
| 88 |
+
"""
|
| 89 |
+
Función que traduce un texto de inglés a español.
|
| 90 |
+
"""
|
| 91 |
+
try:
|
| 92 |
+
if not texto.strip():
|
| 93 |
+
return "No hay texto para traducir."
|
| 94 |
+
|
| 95 |
+
# Tokenizar el texto a traducir
|
| 96 |
+
translated = translator_model.generate(**translator_tokenizer(texto, return_tensors="pt", padding=True))
|
| 97 |
+
|
| 98 |
+
# Decodificar la traducción
|
| 99 |
+
traduccion = translator_tokenizer.decode(translated[0], skip_special_tokens=True)
|
| 100 |
+
return traduccion
|
| 101 |
except Exception as e:
|
| 102 |
+
print(f"Error durante la traducción: {e}")
|
| 103 |
+
return f"Error al traducir el texto: {e}"
|
| 104 |
+
|
| 105 |
+
def procesar_consulta(consulta, idioma):
|
| 106 |
+
"""
|
| 107 |
+
Función que procesa la consulta y devuelve la respuesta original y/o traducida según el idioma seleccionado.
|
| 108 |
+
"""
|
| 109 |
+
respuesta_original = generar_respuesta(consulta)
|
| 110 |
+
|
| 111 |
+
if idioma == "Español":
|
| 112 |
+
traduccion = traducir_texto(respuesta_original)
|
| 113 |
+
else:
|
| 114 |
+
traduccion = ""
|
| 115 |
+
|
| 116 |
+
return respuesta_original, traduccion
|
| 117 |
|
| 118 |
# Definir la interfaz de Gradio
|
| 119 |
+
titulo = "Generador de Respuestas con SelfBioRAG 7B"
|
| 120 |
+
descripcion = "Ingresa una consulta y selecciona el idioma de salida. El modelo generará una respuesta basada en el contenido proporcionado."
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 121 |
|
| 122 |
iface = gr.Interface(
|
| 123 |
+
fn=procesar_consulta,
|
| 124 |
inputs=[
|
| 125 |
+
gr.Textbox(lines=5, placeholder="Escribe tu consulta aquí...", label="Consulta"),
|
| 126 |
+
gr.Dropdown(choices=["Inglés", "Español"], value="Español", label="Idioma de Salida")
|
| 127 |
+
],
|
| 128 |
+
outputs=[
|
| 129 |
+
gr.Textbox(label="Respuesta Original (Inglés)"),
|
| 130 |
+
gr.Textbox(label="Traducción al Español")
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 131 |
],
|
|
|
|
| 132 |
title=titulo,
|
| 133 |
description=descripcion,
|
| 134 |
examples=[
|
| 135 |
[
|
| 136 |
+
"Clasifica el siguiente informe de radiología según la parte del cuerpo a la que se refiere (por ejemplo, pecho, abdomen, cerebro, etc.): Los discos intervertebrales en L4-L5 y L5-S1 muestran signos de degeneración con leve abultamiento que comprime la raíz nerviosa adyacente."
|
| 137 |
],
|
| 138 |
[
|
| 139 |
+
"Resume los puntos clave sobre el papel de las mutaciones en los genes BRCA1 y BRCA2 en el aumento del riesgo de cáncer de mama."
|
| 140 |
]
|
| 141 |
],
|
| 142 |
cache_examples=False,
|